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水質在線監測系統（WQMS）是一套以在線自動分析儀器為核心，采用現代傳感技術、自動測量技術、自動控制技術、計算機應用技術及相關專用分析軟件和通訊網絡組成的一套綜合性的在線自動監測體系。WQMS可以及早發現水質異常變化，對下游水污染進行預警和預測，及時跟蹤污染源，為管理決策服務。 
取水系統 取水系統的設計主要是為了滿足水樣的代表性、可靠性和連續性。系統的主要組成部分有：取水頭、取水泵、水樣輸送管路及流速流量調節。按取水方式劃分，主要分為直取式和浮筒式兩種。直取式主要用于水位變化較小的環境，如污水廠、污染源、自來水涵管等，而浮筒式則主要用于水位變化較大的環境，如地表水等。 預處理系統 水樣預處理的設計主要是為了消除干擾儀器分析和影響儀器使用的因素，同時又不失水樣的代表性。預處理的手段通常包括自然沉降、物理過濾和滲透等。預處理水平通常根據水樣的純度來確定。 一些分析儀器在設計時考慮了進樣的預處理，在系統集成時需要考慮與之配套使用。 集成輔助系統 輔助系統的設計主要是保證在線監測系統的持續穩定運行，需要根據現場情況的變化進行調整。一般來說，應注意以下幾個方面： （1）管道的清洗：由于管道內殘留的污垢和因此而孳生的藻類會污染水樣，所以需要定期、定量地清洗管道。 清潔的方法和內容多種多樣，目標都是為了保證水樣的真實性和代表性。 （2）電力保障：電力的穩定性直接關系到儀器分析的準確性和連續性，所以首先要選擇穩定的交流電網接入；其次在交流電進入自動監測系統前，需要對電流再次整流，以便應對突發性電流不穩的情況的發生；然后，如果需要，可以提供備用電源，以便在停電時在線監測系統的正常運行。 （3）防雷擊：防雷主要分為站房防雷、電源防雷和通訊防雷。遇到雷擊時，電流首先擊穿避雷器，保護儀器和系統設備。這在雷暴頻繁的地區尤為重要。發生雷雨時，工作人員應第一時間檢查避雷器的狀態，如有損壞及時更換。 （4）溫濕度的調節：合適的溫度和濕度對儀器的穩定運行也很重要，而這部分功能主要由空調和除濕設備來實現。 
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